A SBEM existe para estimular o estudo da Endocrinologia e da Metabologia, estreitar o contato entre os especialistas em níveis regional, nacional e internacional, incentivar a pesquisa na área e sua divulgação entre os médicos e para a população, promover a educação continuada, esclarecer diagnósticos, contribuindo, desta forma, para a atualização da terapêutica especializada.

Em nível nacional, a SBEM foi fundada sob o nome de Sociedade de Endocrinologia e Metabologia do Rio de Janeiro, em 1º de setembro de 1950. Em 1954 foi fundada a regional São Paulo e adotado, pela primeira vez, o nome Sociedade Brasileira de Endocrinologia e Metabologia.